БИОИНФОРМАЦИОННАЯ ОЦЕНКА РНК-ЗАВИСИМОЙ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ ГРИБА-паразита Metarhizium anisopliae
Аннотация
Metarhizium anisopliae представляет собой энтомопатогенный гриб, паразитирующий на насекомых, включая тех, которые являются переносчиками инвазии, в том числе, зараженных малярийными паразитами москитов Anopheles. В качестве потенциально новой стратегии контроля переносчиков при исследовании M. anisopliae предлагается использовать биоинженерный метод. Однако, многие грибы-паразиты содержат ген РНК- зависимой РНК-полимеразы (RdRp), который служит защитой от трансгенов. Дана характеристика гена RdRp гриба M. anisopliae, включая его строение, представленное во взаимосвязи с окружающими его генами, и генетическое моделирование, основанное на изучении RdRp белка гриба Neurospora crassa.
Ключевые слова
Об авторах
К. Н. ВЕЙЕР
Институт Медицинских Исследований Уолтера и Элизы Холл;
Мельбурнский университет, Отдел Медицинской Биологии
Австралия
Австралия
1G Ройал Парад, Парквилл 3052, Виктория
Парквилл 3010, Виктория
Э. РОНГ
Европейский институт биоинформатики (EMBL-EBI), Кампус "Wellcome Trust Genome"
Великобритания
Хинкстон, Кембриджшир CB10 1SD
Великобритания
Хинкстон, Кембриджшир CB10 1SD
Г. Ф. КИНГ
Институт молекулярной биологии, Университет Квинсленда
Австралия
Австралия
кандидаты биологических наук
Св. Лючия 4072, Брисбейн, Квинслэнд
Список литературы
1. Nakayashiki H. RNA silencing in fungi: Mechanisms and applications // FEBS Letters. – 2005. – V. 579. – P. 5950–5957.
2. Dang Y. et al. RNA Interference in fungi: Pathways, functions and applications // Eukary Cell. – 2011. – V. 10. – P. 1148–1155.
3. Cogoni C., Macino G. Gene silencing in Neurospora crassa requires a protein homologous to RNA-dependant RNA polymerase // Nature. – 1999. – V. 399. – P. 166–169.
4. Cogoni C. Homology-dependant gene silencing mechanisms in fungi // Annu. Rev. Microbiol. – 2001. – V. 55. – P. 381–406.
5. Fang W., Azimzadeh P., St. Leger R.J. Strain improvement of fungal insecticides for controlling insect pests and vector-borne diseases // Curr. Opin. Microbiol. – 2012. – V. 15. – P. 1–7.
6. Fang W. et al. Development of transgenic fungi that kill human malaria parasites in mosquitoes // Science. – 2011. – V. 331. – P. 1074–1077.
7. Wang C., St. Leger R.J. A scorpion neurotoxin increases the potency of a fungal insecticide // Nature Biotech. – 2007. – V. 25. – P. 1455–1456.
8. Saez N.J. et al. Spider-venom peptides as therapeutics // Toxins. – 2010. – V. 2. – P. 2851–2871.
9. Gao Q. et al. Genome sequencing and comparative transcriptomics of the model entomopathogenic fungi Metarhizium anisopliae and M. acridium // PLoS Genetics. – 2011. – V. 7. – P. 100–126.
10. Salgado P.S. et al. The structure of an RNAi polymerase links RNA silencing and transcription // PLoS Biol. – 2006. – V. 4. – e434.
11. Gohara D.W. et al. Poliovirus RNA-dependent RNA polymerase (3Dpol): structural, biochemical, and biological analysis of conserved structural motifs A and B // J. Biol. Chem. – 2000. – V. 275. – P. 25523–25532.
12. O'Reilly E.K., Kao C.C. Analysis of RNA-dependent RNA polymerase structure and function as guided by known polymerase structures and computer predictions of secondary structure // Virology. – 1998. – V. 252. – P. 287–303.
13. Kupfer D.M. et al. Introns and splicing elements of five diverse fungi // Eukary Cell. – 2004. – V. 3. – P. 1088–10100.
14. Mascarenhas C. et al. Gcn4 is required for the response to peroxide stress in the yeast Saccharomyces cerevisiae // MBoC. – 2008. – V. 19. – P. 2995–3007.
15. Vance V., Vaucheret H. RNA silencing in plants – defense and counter defense // Science. – 2001. – V. 292. – P. 2277–2280.
16. Cremer T., Cremer C. Chromosome territories, nuclear architecture and gene regulation in mammalian cells // Nature Rev Genetics. – 2001. – V. 2. – P. 292–302.
Рецензия
Для цитирования:
ВЕЙЕР К., РОНГ Э., КИНГ Г. БИОИНФОРМАЦИОННАЯ ОЦЕНКА РНК-ЗАВИСИМОЙ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ ГРИБА-паразита Metarhizium anisopliae. Российский паразитологический журнал. 2014;(4):55-63.
For citation:
WEIR C., EWONG E., KING G. A BIOINFORMATICS CHARACTERIZATION OF THE RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE FROM THE PARASITIC FUNGI, Metarhizium anisopliae. Russian Journal of Parasitology. 2014;(4):55-63.
Просмотров:
257
Послать статью по эл. почте 